1. The three-dimensional structure

1. The three-dimensional structure of a protein is determined by its primary, secondary, and tertiary structures. Define the primary, secondary, and tertiary structures. What are some of the common secondary structures? What are the forces that hold together the secondary and tertiary structures? What is the quaternary structure?
2. Proper folding of proteins is essential for biological activity. Describe the roles of molecular chaperones and chaperonins in the folding of proteins.
3. Proteins are degraded in cells. What is ubiquitin, and what role does it play in tagging proteins for degradation? What is the role of proteasomes in protein degradation?
4. Enzymes can catalyze chemical reactions. How do enzymes increase the rate of a reaction? What constitutes the active site of an enzyme? For an enzyme-catalyzed reaction, what are Kmand Vmax? For enzyme X, the Kmfor substrate A is 0.4 mM and for substrate B is 0.01 mM. Which substrate has a higher affinity for enzyme X?
5. Motor proteins, such as myosin, convert energy into a mechanical force. Describe the three general properties characteristic of motor proteins. Describe the biochemical events that occur during one cycle of movement of myosin relative to an actin filament.
6. The function of proteins can be regulated in a number of ways. What is cooperativity, and how does it influence protein function? Describe how protein phosphorylation and proteolytic cleavage can modulate protein function.
7. A number of techniques can separate proteins on the basis of their differences in mass. Describe the use of two of these techniques, centrifugation and gel electrophoresis. The blood proteins transferrin (MW 76 kDa) and lysozyme (MW 15 kDa) can be separated by rate zonal centrifugation or SDS polyacrylamide gel electrophoresis. Which of the two proteins will sediment faster during centrifugation? Which will migrate faster during electrophoresis?
8. Chromatography is an analytical method used to separate proteins. Describe the principles for separating proteins by gel filtration, ion-exchange, and affinity chromatography.
9. Various methods have been developed for detecting proteins. Describe how radioisotopes and autoradiography can be used for labeling and detecting proteins. How does
Western blotting detect proteins?
10. Physical methods are often used to determine protein
conformation. Describe how x-ray crystallography, cryoelectron microscopy, and NMR spectroscopy can be used to
determine the shape of proteins

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

1. struktur tiga dimensi protein ditentukan oleh struktur primer, sekunder dan tersier. Mendefinisikan struktur primer, sekunder dan tersier. Apa adalah beberapa struktur sekunder Umum? Apakah kekuatan yang terus bersama struktur sekunder dan tersier? Apa yang dimaksud dengan struktur kuarter?2. tepat melipat protein sangat penting untuk kegiatan biologis. Menjelaskan peran molekul pendamping dan chaperonins dalam melipat protein.3. protein terdegradasi dalam sel. Apa ubiquitin, dan peran apa melakukannya bermain dalam penandaan protein untuk degradasi? Apakah peran proteasomes di degradasi protein?4. enzim dapat mengkatalisasi reaksi kimia. Bagaimana enzim meningkatkan laju reaksi? Apa yang merupakan situs aktif dari enzim? Untuk reaksi yang dikatalisasi enzim, apa yang Kmand Vmax? Untuk enzim X, substrat Kmfor A adalah 0.4 mM dan untuk substrat B adalah 0.01 mM. Substrat yang memiliki afinitas tinggi untuk enzim X?5. motor protein, seperti myosin, mengubah energi menjadi kekuatan mekanik. Menggambarkan sifat umum tiga karakteristik motor protein. Menggambarkan peristiwa biokimia yang terjadi selama satu siklus pergerakan myosin relatif terhadap aktivitas filamen.6. fungsi protein dapat diatur dalam beberapa cara. Apa cooperativity, dan bagaimana hal itu mempengaruhi fungsi protein? Menggambarkan bagaimana fosforilasi protein dan pembelahan proteolitik dapat memodulasi fungsi protein.7. beberapa teknik dapat memisahkan protein berdasarkan perbedaan massa. Menjelaskan penggunaan dua teknik, sentrifugasi dan Elektroforesis gel. Darah protein transferrin (MW 76 kDa) dan losozyme (MW 15 kDa) dapat dipisahkan oleh sentrifugasi zonal tingkat atau SDS polyacrylamide Elektroforesis. Yang dua protein akan sedimen lebih cepat selama sentrifugasi? Yang akan bermigrasi lebih cepat selama Elektroforesis?8. kromatografi adalah metode analisis yang digunakan untuk memisahkan protein. Menggambarkan prinsip-prinsip untuk memisahkan protein oleh gel filtrasi, pertukaran ion dan afinitas kromatografi.9. berbagai metode telah dikembangkan untuk mendeteksi protein. Menggambarkan bagaimana radioisotopes dan autoradiography dapat digunakan untuk pelabelan dan mendeteksi protein. Bagaimana ApakahBarat blotting mendeteksi protein?10. fisik metode yang sering digunakan untuk menentukan proteinkonformasi. Menggambarkan bagaimana kristalografi sinar-x, NMR spektroskopi dan cryoelectron mikroskop dapat digunakan untukmenentukan bentuk protein

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

1. struktur tiga dimensi protein ditentukan oleh utama, sekunder, tersier dan struktur. Menentukan struktur primer, sekunder, dan tersier. Apa adalah beberapa struktur sekunder umum? Apa kekuatan yang menyatukan struktur sekunder dan tersier? Bagaimana struktur kuaterner?
2. Lipat yang tepat dari protein sangat penting untuk aktivitas biologis. Menggambarkan peran pendamping molekul dan chaperonins di lipat protein.
3. Protein terdegradasi dalam sel. Apa ubiquitin, dan peran apa yang bermain di penandaan protein untuk degradasi? Apa peran proteasomes di degradasi protein?
4. Enzim dapat mengkatalisasi reaksi kimia. Bagaimana enzim meningkatkan laju reaksi? Apa yang merupakan situs aktif enzim? Untuk reaksi enzim-katalis, apa Kmand Vmax? Untuk enzim X, Kmfor substrat A adalah 0,4 mM dan untuk substrat B adalah 0,01 mM. Yang substrat memiliki afinitas yang lebih tinggi untuk enzim X?
5. Protein motor, seperti myosin, mengubah energi menjadi kekuatan mekanik. Menggambarkan tiga sifat umum karakteristik protein motor. Menggambarkan peristiwa biokimia yang terjadi selama satu siklus dari pergerakan myosin relatif terhadap filamen aktin.
6. Fungsi protein dapat diatur dalam beberapa cara. Apa kooperatititas, dan bagaimana cara mempengaruhi fungsi protein? Jelaskan bagaimana fosforilasi protein dan pembelahan proteolitik dapat memodulasi fungsi protein.
7. Sejumlah teknik dapat memisahkan protein berdasarkan perbedaan mereka dalam massa. Menggambarkan penggunaan dua teknik, sentrifugasi dan gel elektroforesis. Protein darah transferin (MW 76 kDa) dan lisozim (MW 15 kDa) dapat dipisahkan dengan tingkat sentrifugasi zonal atau SDS gel poliakrilamid elektroforesis. Manakah dari dua protein akan mengendap lebih cepat selama sentrifugasi? Yang akan bermigrasi lebih cepat selama elektroforesis?
8. Kromatografi adalah suatu metode analisis yang digunakan untuk memisahkan protein. Menjelaskan prinsip-prinsip untuk memisahkan protein dengan filtrasi gel, pertukaran ion, dan kromatografi afinitas.
9. Berbagai metode telah dikembangkan untuk mendeteksi protein. Jelaskan bagaimana radioisotop dan autoradiografi dapat digunakan untuk pelabelan dan mendeteksi protein. Bagaimana
Western blotting mendeteksi protein?
10. Metode fisik yang sering digunakan untuk menentukan protein
konformasi. Jelaskan bagaimana kristalografi sinar-x, cryoelectron mikroskop, dan spektroskopi NMR dapat digunakan untuk
menentukan bentuk protein