Salmonella isolat milik serovar Anatum (S. Anatum) (n = 10, Blockley (S.Bockley) (n = 15), infantis (S. infantis) (n = 12), Hadar (S. Hadar) (n = 21 ) dan Typhimurium (S.Typhimurium) (n = 15), yang dipelajari dengan menggunakan PFGE seperti dijelaskan sebelumnya dengan sedikit modifikasi [11]. Sel-sel tumbuh selama malam di piring agar darah pada suhu 37 ° C. Setiap kebudayaan ditangguhkan TE penyangga ( 100 mM Tris-HCl, 100 mM asam ethylenediaminetetraacetic, pH 8,0). untuk mempersiapkan colokan agarosa, 10 ml proteinase K (2000 mg / dL saham) ditambahkan ke 190 ml suspensi sel yang disesuaikan. Kemudian, 200 ml meleleh 1% Megabase Bersertifikat agarose (Biorad, Hamstead, UK) ditambahkan ke 200 suspensi sel ml / campuran Proteinase K dan dicampur dengan lembut. campuran segera dibagikan ke sumur cetakan plug. sel-sel bakteri di colokan agarose segaris dengan pengobatan dengan larutan lisis yang mengandung 0,1 mg / ml Proteinase K (Gibco-BRL, Gaithersburg, MD), 50 mM Tris-HCl (pH 8,0), 50 mM EDTA, dan 1% N-lauroylsarcosine, selama 2 jam pada 54 ° C. Colokan yang dicerna dengan 40 U pembatasan
enzim XbaI (Promega Corp, Madison, WI) selama 4 jam pada suhu 37 ° C. Fragmen dicerna diselesaikan dalam 1% agarosa SeaKem Emas gel (Lonza, Rockland, Maine)
di 0,5 × Tris-Borat-EDTA (TBE) penyangga menggunakan kontur dijepit homogen medan listrik (CHEF) aparat (CHEF-DR III, Bio Rad Laboratories, Richmond, CA). Elektroforesis dilakukan pada 6 V / cm dengan 2,2-63,8 s waktu jalan linear untuk 19 jam. Gel didinginkan pada 14 ° C selama run dan kemudian diwarnai dengan etidium bromida dan destained dengan air suling. Pola bandeng divisualisasikan dengan UV dan difoto (Gel Doc 2000 Imager, Biorad). Salmonella ser. Standar Braenderup H9812 PulseNet digunakan sebagai penanda berat molekul setelah pencernaan dengan XbaI [16].
Sedang diterjemahkan, harap tunggu..
