Metabolic models usually contain ma

Metabolic models usually contain many sub-optimal modes--modes with a lower yield--or non-operational modes--modes that cannot produce any objective flux. Our toy network was designed to not contain suboptimal operational modes. The non-operational mode is the lineality shown in Fig. 2A.

The EFM analysis further showed that we can describe the optimal solution space with different sets of vertices. For instance, CoPE-FBA gave that {R2} was part of each vertex and {R3, R4} was only part of a lineality. We can reverse this situation by making {R2} part of the lineality and {R3, R4} part of each vertex, hence this decomposition is not unique.

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

Model metabolik biasanya mengandung banyak sub-optimal mode - mode dengan hasil yang lebih rendah--atau non-operasional mode - mode yang tidak menghasilkan apapun fluks objektif. Jaringan mainan kami dirancang untuk tidak mengandung suboptimal operasional mode. Mode non-operasional adalah lineality yang ditampilkan dalam Fig. 2A.EFM analisis lebih lanjut menunjukkan bahwa kita dapat menggambarkan ruang solusi optimal dengan set yang berbeda dari simpul. Sebagai contoh, mengatasi-FBA memberikan bahwa {R2} adalah bagian dari setiap node dan {R3, R4} adalah hanya bagian dari lineality. Kita bisa membalikkan situasi ini dengan membuat bagian bagian dari lineality dan {R3, R4} {R2} vertex masing-masing, maka dekomposisi ini tidak unik.

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

Model metabolik biasanya mengandung banyak mode sub-optimal - mode dengan yield yang lebih rendah - atau mode non-operasional - mode yang tidak dapat menghasilkan fluks tujuan apapun. Jaringan mainan kami dirancang untuk tidak mengandung mode operasional suboptimal. Mode non-operasional adalah lineality ditunjukkan pada Gambar. 2A.

Analisis EFM lebih lanjut menunjukkan bahwa kita dapat menggambarkan ruang solusi optimal dengan set yang berbeda dari simpul. Misalnya, Cope-FBA memberi yang {R2} adalah bagian dari setiap sudut dan {R3, R4} hanya bagian dari lineality a. Kami bisa membalikkan situasi ini dengan membuat {R2} bagian dari lineality dan {R3, R4} bagian dari setiap sudut, maka dekomposisi ini tidak unik.