For example, despite comparable env

For example, despite comparable environmental conditions, mangrove species richness is dramatically higher in the Indo‒West Pacific (65 species of 23 genera) compared to the Atlantic East Pacific (15 species of 8 genera) [2]. A number of hypotheses have been proposed during the last century to explain these distributional differences [9, 10, 11, 12, 13, 14], but the view of each author is best considered dated – with comparisons made under essential caveats. For instance, the hypothesis for long-distance dispersal and its ‘centre of origin’ concept [9, 10] was proposed before the theory of continental drift was generally accepted, when molecular genetics was at its infancy, and, when there were few fossil records. Thus, while the old ‘dispersal’ view might regard mangrove taxa originated in the Indo West Pacific and subsequently dispersed to other parts of the world, a modern ‘vicariance’ view is that mangroves evolved around the Tethys Sea during the Late Cretaceous [6, 15]. Phylogeographic analysis of one of the most widespread mangrove genera, Rhizophora, integrating genetic relationships, fossil records and geological/tectonic processes, will help to elucidate the role of vicariance and long-distance dispersal in the historical development of contemporary biogeographic patterns of mangroves, and to provide objective evaluation of these different but not mutually exclusive views. Rhizophora is a dominant genus of the most widespread mangrove family, the Rhizophoraceae. The genus is relatively old amongst cosmopolitan mangrove genera, and it has notable disjunct species distributions in both the Atlantic East Pacific and Indo West Pacific. Fossils of Rhizophora are recorded from the Palaeocene (55.8-65.5 Ma) onwards in major global regions [5]. All Rhizophora taxa are characterized by large water-buoyant propagules with a remarkable ability for long-distance dispersal.
For instance, recent genetic study using rapidly evolving microsatellites showed that Rhizophora mangle has dispersed over 3,000 miles from the north to south of the Brazilian coast since the end of the last glacial period [16]. While Rhizophora species are widespread in the world, only six (plus an equivalent number of hybrids) are described: Rhizophora apiculata, Rhizophora mucronata, and Rhizophora stylosa in the IWP; Rhizophora mangle and Rhizophora racemosa in the AEP; and Rhizophora samoensis, the only species found naturally in both regions [6]. In addition to the presence of major disjunctions in Rhizophora species distributions, the extant populations are not morphologically uniform and continuous at the intraspecific level [6], partly due to persistent introgressive hybridization, for example, among the New World Rhizophora[17]. While the reason for these disjunct occurrences might be complex, once created most discontinuities were persistent over millions of years – as evidenced by Wallace’s Line in the IWP region.
Geographical disjunctions of plant and animal lineages can arise through historical long distance dispersal to new areas or through vicariant events that create physical barriers to gene flow and hence facilitate population divergence or allopatric speciation. Although the distributional patterns associated with vicariance may not be always distinct from those caused by dispersal, this can be tested by comparing selected scenarios of evolutionary relationships among disjunct and other lineages, molecular dating of lineage-splitting events, timing of geological processes or tectonic movements, as well as dispersal ability of the organisms of interest. There is also ample evidence for lineage diversification via a combination of mechanisms including both dispersal and vicariance [18]. The objectives of this study are to elucidate evolutionary relationships among its geographical lineages of Rhizophora (Figure 1; Table 1) in the light of the past geological events including continental drift, to illuminate major disjunctions at both inter- and intraspecific levels, and to generate a new hypothesis that combines both processes of vicariance and dispersal to explain the extant geographical distributions. Our estimation of divergence times for major lineages will shed light on the likely ancestral areas of Rhizophora.


Distribution and Rarity of Rhizophoraceae in Indonesia

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

Sebagai contoh, meskipun kondisi lingkungan yang sebanding, kekayaan spesies mangrove secara dramatis lebih tinggi di Pasifik Indou2012West (65 spesies dari 23 genera) dibandingkan dengan Atlantic Timur Pasifik (15 spesies dari 8 genera) [2]. Sejumlah hipotesis telah diajukan selama abad terakhir untuk menjelaskan perbedaan-perbedaan distribusi ini [9, 10, 11, 12, 13, 14], tetapi pandangan setiap penulis terbaik dianggap tanggal-dengan perbandingan dibuat di bawah peringatan penting. Misalnya, dengan konsep 'pusat asal' [9, 10] dan hipotesis untuk jarak jauh penyebaran diusulkan sebelum teori continental drift umumnya diterima, ketika genetika molekuler pada masa kanak-kanak, dan, ketika ada beberapa catatan fosil. Jadi, sementara 'penyebaran' pandangan lama mungkin menganggap bakau taksa berasal dari Indo Pasifik Barat dan kemudian tersebar ke bagian lain dari dunia, pandangan modern 'vicariance' adalah bahwa hutan bakau berevolusi di sekitar laut Tethys selama akhir Cretaceous [6, 15]. Phylogeographic analisis dari salah satu paling luas hutan bakau genera, bakau, mengintegrasikan hubungan genetik, catatan fosil dan proses geologi/tektonik, akan membantu untuk menelaah peran vicariance dan penyebaran jarak jauh dalam perkembangan sejarah kontemporer pola biogeografis hutan bakau, dan untuk memberikan evaluasi objektif ini berbeda tetapi pemandangan yang tidak saling eksklusif. Bakau adalah genus dominan keluarga bakau yang paling luas, Rhizophoraceae. Genus ini relatif lama antara genera kosmopolitan bakau, dan memiliki distribusi spesies sebaran yang terkenal baik di Atlantic Timur Pasifik dan Indo Pasifik Barat. Fosil bakau tercatat dari Palaeocene (65.5 55,8 Ma) dan seterusnya dalam wilayah global utama [5]. Semua bakau taksa dicirikan oleh propagules apung air yang besar dengan kemampuan luar biasa untuk penyebaran jarak jauh.For instance, recent genetic study using rapidly evolving microsatellites showed that Rhizophora mangle has dispersed over 3,000 miles from the north to south of the Brazilian coast since the end of the last glacial period [16]. While Rhizophora species are widespread in the world, only six (plus an equivalent number of hybrids) are described: Rhizophora apiculata, Rhizophora mucronata, and Rhizophora stylosa in the IWP; Rhizophora mangle and Rhizophora racemosa in the AEP; and Rhizophora samoensis, the only species found naturally in both regions [6]. In addition to the presence of major disjunctions in Rhizophora species distributions, the extant populations are not morphologically uniform and continuous at the intraspecific level [6], partly due to persistent introgressive hybridization, for example, among the New World Rhizophora[17]. While the reason for these disjunct occurrences might be complex, once created most discontinuities were persistent over millions of years – as evidenced by Wallace’s Line in the IWP region.Geographical disjunctions of plant and animal lineages can arise through historical long distance dispersal to new areas or through vicariant events that create physical barriers to gene flow and hence facilitate population divergence or allopatric speciation. Although the distributional patterns associated with vicariance may not be always distinct from those caused by dispersal, this can be tested by comparing selected scenarios of evolutionary relationships among disjunct and other lineages, molecular dating of lineage-splitting events, timing of geological processes or tectonic movements, as well as dispersal ability of the organisms of interest. There is also ample evidence for lineage diversification via a combination of mechanisms including both dispersal and vicariance [18]. The objectives of this study are to elucidate evolutionary relationships among its geographical lineages of Rhizophora (Figure 1; Table 1) in the light of the past geological events including continental drift, to illuminate major disjunctions at both inter- and intraspecific levels, and to generate a new hypothesis that combines both processes of vicariance and dispersal to explain the extant geographical distributions. Our estimation of divergence times for major lineages will shed light on the likely ancestral areas of Rhizophora.Distribution and Rarity of Rhizophoraceae in Indonesia

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

Misalnya, meskipun kondisi lingkungan yang sebanding, jenis mangrove kekayaan secara dramatis lebih tinggi di Pasifik Indo-Barat (65 spesies dari 23 genera) dibandingkan Atlantik Pasifik Timur (15 spesies dari 8 genera) [2]. Sejumlah hipotesis telah diajukan selama abad terakhir untuk menjelaskan perbedaan-perbedaan distribusi [9, 10, 11, 12, 13, 14], tapi lihat dari setiap penulis paling dianggap tanggal - dengan perbandingan yang dibuat di bawah peringatan penting. Misalnya, hipotesis untuk penyebaran jarak jauh dan 'pusat asal' nya konsep [9, 10] diusulkan sebelum teori pergeseran benua itu berlaku umum, ketika genetika molekuler berada di masa pertumbuhan, dan, ketika ada beberapa fosil catatan. Jadi, sementara yang lama 'penyebaran' lihat mungkin menganggap taksa bakau berasal Indo Pasifik Barat dan kemudian tersebar ke bagian lain dari dunia, modern 'vikariansi' lihat adalah bahwa mangrove berkembang di sekitar Laut Tethys selama Late Cretaceous [6, 15]. Analisis Phylogeographic dari salah satu genera bakau paling luas, Rhizophora, mengintegrasikan hubungan genetik, catatan fosil dan geologi / proses tektonik, akan membantu untuk menjelaskan peran vikariansi dan jarak jauh penyebaran dalam sejarah perkembangan pola biogeografi kontemporer mangrove, dan untuk memberikan evaluasi obyektif dari pandangan-pandangan yang berbeda tetapi tidak saling eksklusif. Rhizophora adalah genus dominan dari keluarga bakau paling luas, yang Rhizophoraceae. Genus ini relatif lama antara genera bakau kosmopolitan, dan memiliki terkenal distribusi spesies terpisah di kedua Atlantik Timur Pasifik dan Indo Pasifik Barat. Fosil Rhizophora dicatat dari Palaeocene (55,8-65,5 Ma) dan seterusnya di wilayah global utama [5]. Semua Rhizophora taksa ditandai dengan propagul air-apung besar dengan kemampuan luar biasa untuk penyebaran jarak jauh.
Misalnya, penelitian genetik terbaru menggunakan berkembang pesat mikrosatelit menunjukkan bahwa Rhizophora mangle telah tersebar lebih dari 3.000 mil dari utara ke selatan dari pantai Brasil sejak akhir periode glasial terakhir [16]. Sementara spesies Rhizophora tersebar luas di dunia, hanya enam (ditambah jumlah setara hibrida) dijelaskan: Rhizophora apiculata, Rhizophora mucronata, dan Rhizophora stylosa di IWP; Rhizophora mangle dan Rhizophora racemosa dalam AEP; dan Rhizophora samoensis, satu-satunya spesies yang ditemukan secara alami di kedua daerah [6]. Selain kehadiran disjunctions utama di Rhizophora distribusi spesies, populasi yang masih ada tidak morfologis seragam dan berkesinambungan di tingkat intraspecific [6], sebagian karena hibridisasi introgressive gigih, misalnya, antara New World Rhizophora [17]. Sementara alasan untuk ini kejadian terpisah mungkin menjadi kompleks, setelah dibuat paling diskontinuitas yang gigih selama jutaan tahun -. Sebagaimana dibuktikan oleh Garis Wallace di wilayah IWP
disjunctions geografis dari tanaman dan hewan garis keturunan dapat timbul melalui sejarah penyebaran jarak jauh ke daerah-daerah baru atau melalui acara vicariant yang menciptakan hambatan fisik untuk aliran gen dan karenanya memfasilitasi divergensi populasi atau spesiasi allopatric. Meskipun pola distribusi terkait dengan vikariansi mungkin tidak selalu berbeda dari yang disebabkan oleh penyebaran, ini dapat diuji dengan membandingkan skenario yang dipilih hubungan evolusi terpisah dan lainnya garis keturunan, kencan molekul peristiwa keturunan-membelah, waktu proses geologi atau gerakan tektonik , serta kemampuan penyebaran organisme bunga. Ada juga banyak bukti untuk diversifikasi keturunan melalui kombinasi mekanisme termasuk baik penyebaran dan vikariansi [18]. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menjelaskan hubungan evolusioner antara garis keturunan geografis dari Rhizophora (Gambar 1; Tabel 1) dalam terang peristiwa geologi masa lalu termasuk pergeseran benua, untuk menerangi disjunctions utama baik di tingkat internasional dan intraspecific, dan untuk menghasilkan hipotesis baru yang menggabungkan kedua proses vikariansi dan penyebaran untuk menjelaskan distribusi geografis yang masih ada. Estimasi kami kali perbedaan untuk garis keturunan utama akan menjelaskan daerah leluhur kemungkinan Rhizophora. Distribusi dan Kelangkaan dari Rhizophoraceae di Indonesia