3. RESULTS AND DISCUSSION3.1 Isolat

3. RESULTS AND DISCUSSION
3.1 Isolation of Antibiotic-Producing Microorganisms
The primary screening of residential and recreational soils yielded a total of 71 and 9
promising APS with growth inhibitory properties, respectively
Table 1. Count of residential and recreational soil isolates displaying antibioticproducing capacities at different screening stages
All isolates selected from primary screening were re-screened by PCPM. Most isolates
obtained from recreational sites showed insufficient inhibitory capacities against all nineteen
pathogenic microorganisms during secondary screening. Only one isolate (L59) from
recreational sites insistently exhibited growth inhibitory properties, inhibiting B. cereus, C.
albicans, P. fluorescence, S. aureus, and S. zooepidemicus on NA medium (Table 2). The
broad range of isolates from residential soil samples, i.e. 11 (21.2%), 4 (33.3%), and 4
(57.5%) isolates, displayed sufficient growth inhibitory properties on NA, PDA, and TSA
media, respectively (Table 1). Recreational soil did not reveal isolates with growth inhibitory
properties on TSA or PDA medium, and overall yielded nearly six times less APS than
residential soil (Table 1, P = .05).
Table 2. Soil isolates displaying robust growth inhibitory properties after secondary
screenings by cross-plate assay against 19 pathogens on three different media
ATCC
Pathogens
Gram
staining
PDA NA TSA.
The single remaining recreational soil-derived isolate (L59) persisted through this screening. Overall, a
total of 15 different antibiotic-producing isolates with sufficient inhibitory potential were
isolated and further characterized. The single remaining recreational soil-derived isolate
(L59) persisted through this screening. Overall, a total of 15 different antibiotic-producing
organisms with sufficient inhibitory potential were isolated and further characterized. During
our study, isolates’ inhibitory capacities alternated at different screening stages. At some
stages they displayed growth suppressive abilities towards certain pathogens but lost or
switched these inhibitory abilities toward other pathogens during a different screening stage
(Table 1-2). These observations may indicate the presence of highly spontaneous antibioticspecificity swapping involved interdependently in antibiotic synthesis between soil isolates within an optimal microenvironment, and support previous studies which specify the robust
influence of neighboring microorganisms on surrounding bacterial antibiotic secretion [13].
3.2 Growth-Inhibitory Assessment
Individual values of average zone of inhibition (ZOI) of each isolate are summarized in Table
3, and reveal Y14 with the largest ZOI (10.16mm), demonstrated against pathogen K.
kristinae on PDA media. Isolate Y13 exhibited its maximum inhibitory perimeter against S.
marcescess (9.40mm). Y14p and Y44 displayed their maximum inhibitory perimeters against
K. kristinae (10.16mm and 2.01mm, respectively). Y16 and Y67p displayed their largest
inhibitory perimeters against L. monocytogenes (2.54mm and 2.54mm). Y16a revealed
maximum ZOI against O. anthropi (2.54mm). The isolate Y17p exhibited its maximum
inhibitory perimeter against P. fluorescence, C. albicans and S. aureus (2.54mm, 2.54 mm,
and 2.54 mm). Y29p displayed its largest inhibitory zone against P. fluorescence and S.
aureus (2.54mm and 2.54mm). Similarly, Y39 had its greatest inhibitory perimeter against
En. saccharolyticus (2.29mm). Y40p greatest inhibitory perimeter was against P.
fluorescence (2.54mm). The isolates Y49 and L59 maximum inhibitory perimeter was
against S. aureus (6.35 mm and 6.10 mm). Y63p largest ZOI was against S.
zooepiderimicus (3.81mm). Y64a maximum ZOI was against C. albicans (2.54mm). Y64b
largest ZOI was against L. monocytogenes (5.08 mm).
Furthermore, the APSs antibiotic potency (A.P) and average range of growth inhibition of
pathogenic microorganisms were determined. Isolates Y17p andY14p demonstrated the
greatest A.P, which was observed against P. fluorescence (A.P. = 5) and M. luteus (A.P. =
5), respectively. Y63p however had the widest range of pathogenic inhibition, revealing
growth suppressive capacities against more than 60% of the screened clinically-relevant
pathogens L. monocytogenes, En. saccharolyticus, K. kristinae, K. faecalis, M. luteus, O.
anthropi, S. cerevisiae, S. aureus, S. scuiri, and S. zooepiderimicus. Among the isolated
microorganisms, isolates Y14p, Y63p, and Y13 had the greatest P.I.I (i.e. 35.3, 26.1, and
25.3), respectively, as the combination of their range of pathogenic inhibition, A.P, and ZOI
was the greatest (Fig. 1a). Isolates Y44, and Y39 demonstrated the weakest A.P,
respectively. No isolate was able to inhibit K. pneumoniae, K. oxytoca, and S. thermophilus.
As anticipated, positive correlations existed between A.P, P.I.I (c.c=0.85, P = .05), ZOI
(c.c=0.92, P = .05), and the range of pathogens inhibition (Fig. 1d; c.c= 0.76; P = .05) (Fig. 1
b,c
Fig. 1. Mean pathogenic inhibitory index of soil isolates
A: Several soil isolates revealed elevated mean pathogenic index. B: Positive correlation displayed
between APS’ antibiotic potency and Pathogenic Inhibitory Index (Correlation coefficient=0.96, P =
.05). Mean (± S.E.M). C: Positive correlation demonstrated between antibiotic potency and zone of
inhibition measurement (c.c=0.84, p > 0.05). Mean (± S.E.M). D: Positive correlation displayed
between the range of pathogenic inhibition and the Pathogenic Inhibitory Index (c.c= -0.20, * P = .05)
3.3 Detection of Plasmid DNA
To determine the molecular elements which may be involved in antibiotic production in site
specific soil isolates, we looked for plasmid DNA existence and found it in several residential
soil-derived APSs, designated as Y14p, Y29p, Y40p, Y17p, Y63p, and Y67p (Fig. 2a). These
isolates exhibited significantly greater P.I.I than plasmid-free APSs (Fig. 2b). Four plasmid
bearing APSs (Y14p, Y17p, Y63p, and Y67p) demonstrated substantial growth suppression
against L. monocytogenes and S. aureus, but the broadest inhibition was demonstrated
against P. fluorescens by 83.3 % of pDNA-bearing APSs (Table 3). Contrarily, only 22.2% of
pDNA free isolates (Y13, Y16a, and L59) were able to inhibit P. fluorescence. Some pDNA
free isolates (i.e. Y44, Y13, Y64b, Y16, Y16a, Y64a), however displayed strong inhibitory
properties against either S. sciuri, or S. cerevisiae, but the majority (55.6%; i.e. Y44, Y16,
Y16a, Y49, Y64a) demonstrated inhibition against K. kristinae (Table 3).
The ability of residential soil-dwelling pDNA isolates to inhibit both gram-negative and
positive bacteria suggests they possess neutrophilic, as well as aciduric and chromate-like
properties, producing antibiotics similar to β-lactam, 6-anilinouracils (AUs), tetracyclic,
oxytertracycline or other polycyclic compounds which certainly present potential for foodborne and nosocomial disease applications [17]. Generally, pDNA-free APSs demonstrated
potent antibiotic properties against S. sciuri and K. kristinae, gram-positive facultative
anaerobes which are normal inhabitants of human tissue and have been cited to cause a
wide range of infectious diseases [18]. Among the screened pathogens was S. aureus, the
pathogen responsible for Methicillin-Resistant Staphulococcus aureus (MRSA) development,
which has been identified as the most common cause of nosocomial diseases, often
acquired outside the household and brought back into residential communities by returning
patients [19]. In our studies, over 66.6% of residential plasmid-borne isolates conferred
inhibitory qualities against S. aureus (Table 3), indicating that residential soil could be a
substantially evolving reservoir for antibiotic-producing isolates, constantly adapting to
pathogens obtained from various environments and subsequently developing novel and
specific antibiotics against resistant strains.
Fig. 2A. Plasmid DNA profiles and pathogenic Inhibitory index of soil-isolated
antibiotic-producing microorganisms
A: (a) Isolates Y14, Y17, Y29, Y40, Y63, and Y67 (Lanes #3, 7, 8, 1 1, 12, and 15, respectively)
revealed pDNA presence,
3.4 Phylogenetic Relationships of Potent Antibiotic-Producing
Microorganisms
Due to their foremost ZOI perimeters and their consistency in pathogenic inhibition, the three
soil isolates Y14p, Y16, and Y40p were attempted to identify using 16S rRNA based
sequence analysis of phylogenetic relationship. The partial sequences of 956 bp, 958 bp,
and 953 bp of Y14p, Y16, and Y40, respectively, were compared with closest relatives from
GenBank and Ribosomal Database Project (RDP) release 10
(http://rdp.cme.msu.edu/index.jsp). The sequence analysis of 16S rRNA revealed the
isolates Y14p, Y16, and Y40 to be closely related to family Enterobacteriaceae,
Xanthomonadaceae, and Bacillaceae, respectively (Fig. 3a-c). All three organisms (i.e.
Y14p, Y16, and Y40) showed close proximity with genus Enterobacter sp.
Stenotrophomonas sp., and Bacillus sp., respectively (Fig. 3a-c). Further, the sequences for
Y14p, Y16, and Y40 were deposited in GenBank database under the accession numbers
JQ956432, JQ956433, and JX121858, respectively. The GenBank and RDP profiles of
isolate Y16 closely matched that of Stenotrophomonas sp., gram-negative obligate aerobes
found in water and soil. They are cited as pDNA carriers and have been noted for their
robust resistance to antibiotics as well as their role in nosocomial infe

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

3. HASIL dan diskusi
3.1 Mikroorganisme menghasilkan isolasi antibiotik
pemutaran utama tanah tempat tinggal dan rekreasional menghasilkan total 71 dan 9
menjanjikan APS dengan pertumbuhan properti penghambatan, masing-masing
tabel 1. Jumlah tanah tempat tinggal dan rekreasional mengisolasi menampilkan antibioticproducing kapasitas berbeda penyaringan tahap
Ternyata semua isolat yang dipilih dari penyaringan primer kembali diputar oleh PCPM. Kebanyakan isolat
Diperoleh dari situs rekreasi menunjukkan kurangnya kapasitas penghambatan terhadap semua sembilan belas
patogen mikroorganisme selama pemeriksaan sekunder. Hanya satu mengisolasi (L59) dari
situs rekreasi terus-menerus dipamerkan properti penghambatan pertumbuhan, menghambat B. cereus, C.
albicans, P. fluorescence, S. aureus, dan S. zooepidemicus pada NA media (Tabel 2).
Mengisolasi berbagai isolat dari sampel tanah perumahan, yaitu 11 (21.2%), 4 (33,3%), dan 4
(57.5%), cukup pertumbuhan ditampilkan properti penghambatan NA, PDA dan TSA
media, masing-masing (Tabel 1). Rekreasi tanah tidak mengungkapkan isolat dengan penghambatan pertumbuhan
properti di media TSA atau PDA, dan secara keseluruhan menghasilkan APS hampir enam kali lebih sedikit daripada
perumahan tanah (Tabel 1, P = 05).
Tabel 2. Tanah mengisolasi menampilkan properti penghambatan pertumbuhan yang kuat setelah menengah
pemutaran oleh salib-piring assay terhadap 19 patogen pada tiga media yang berbeda
ATCC
patogen
Gram
pewarnaan
NA PDA TSA.
satu sisa rekreasi berasal dari tanah isolat (L59) tetap bertahan melalui pemeriksaan ini. Secara keseluruhan,
sebanyak 15 berbeda memproduksi antibiotik isolat dengan potensi penghambatan cukup
terisolasi dan selanjutnya ditandai. Tunggal rekreasi sisanya berasal dari tanah isolate
(L59) bertahan melalui pemeriksaan ini. Secara keseluruhan, total 15 berbeda antibiotik memproduksi
organisme dengan potensi penghambatan cukup terisolasi dan selanjutnya ditandai. Selama
penelitian kami, kapasitas penghambatan isolat berganti-ganti di tahap penyaringan yang berbeda. Beberapa
tahap mereka ditampilkan pertumbuhan kemampuan penekanan terhadap patogen tertentu tetapi kehilangan atau
beralih kemampuan ini penghambatan terhadap patogen lain selama tahap penyaringan berbeda
(Tabel 1 - 2). Pengamatan ini dapat menunjukkan adanya sangat spontan antibioticspecificity menukar terlibat interdependently dalam antibiotik sintesis antara tanah isolat dalam mikro yang optimal, dan dukungan studi sebelumnya yang menentukan kuat
pengaruh tetangga mikroorganisme di sekitarnya sekresi antibiotik bakteri [13].
3.2 penghambatan pertumbuhan penilaian
Nilai-nilai individu rata-rata zona inhibisi (ZOI) setiap isolat diringkas dalam tabel
3, dan mengungkapkan Y14 dengan ZOI terbesar (10.16 mm), menunjukkan terhadap patogen K.
kristinae PDA media. Mengisolasi Y13 dipamerkan pinggirannya penghambatan maksimum terhadap S.
marcescess (9,40 mm). Y14p dan Y44 ditampilkan mereka maksimum strategis penghambatan terhadap
K. kristinae (10.16 mm dan 2,01 mm, masing-masing). Y16 dan Y67p ditampilkan terbesar mereka
strategis penghambatan terhadap L. monocytogenes (2,54 mm dan 2,54 mm). Y16a mengungkapkan
maksimum ZOI terhadap O. anthropi (2,54 mm). Y17p mengisolasi dipamerkan maksimum yang
perimeter penghambatan terhadap P. fluorescence, C. albicans dan S. aureus (2,54 mm, 2.54 mm,
dan 2.54 mm). Y29p ditampilkan dalam zona penghambatan terbesar terhadap P. fluorescence dan S.
aureus (2,54 mm dan 2,54 mm). Demikian pula, Y39 telah pinggirannya penghambatan terbesar terhadap
En. saccharolyticus (2,29 mm). Y40p perimeter penghambatan terbesar adalah melawan P.
fluoresensi (2,54 mm). Isolat tersebut Y49 dan L59 adalah maksimum penghambatan perimeter
terhadap S. aureus (6.35 mm dan 6,10 mm). Y63p ZOI terbesar adalah melawan S.
zooepiderimicus (3,81 mm). Y64a maksimum ZOI adalah melawan C. albicans (2,54 mm). Y64b
ZOI terbesar adalah melawan L. monocytogenes (5.08 mm).
selanjutnya, APSs antibiotik potensi (A.P) dan rata-rata berkisar dari penghambatan pertumbuhan
patogen mikroorganisme ditentukan. Isolat Y17p andY14p menunjukkan
A.P terbesar, yang dipelihara terhadap P. fluorescence (A.P. = 5) dan M. luteus (A.P. =
5), masing-masing. Y63p namun memiliki jangkauan terluas inhibisi patogen, mengungkapkan
pertumbuhan kapasitas penekanan terhadap lebih dari 60% dari disaring secara klinis relevan
patogen L. monocytogenes, En. saccharolyticus, K. kristinae, K. faecalis, M. luteus, O.
anthropi, S. cerevisiae, S. aureus, S. scuiri, dan S. zooepiderimicus. Antara terisolasi
mikroorganisme, isolat Y14p, Y63p, dan Y13 telah P.I.I terbesar (yaitu 35,3, 26,1, dan
25,3), masing-masing, kombinasi dari jangkauan mereka inhibisi patogen, A.P dan ZOI
adalah terbesar (Fig. 1a). Isolat Y44, dan Y39 menunjukkan A.P,
respectively yang terlemah. Isolat tidak mampu menghambat K. pneumoniae, K. oxytoca, dan S. thermophilus.
sebagai antisipasi, ada korelasi positif antara A.P, P.I.I (c.c=0.85, P = 05), ZOI
(c.c=0.92, P = 05), dan kisaran inhibisi patogen (Fig. 1 d; c.c= 0,76; P = 05) (Fig. 1
b, c
gambar 1. Rata-rata indeks penghambatan patogen tanah isolat
A: beberapa tanah mengisolasi ditinggikan mengungkapkan berarti indeks patogen. B: korelasi positif ditampilkan
antara APS' potensi antibiotik dan patogen penghambatan indeks (korelasi koefisien = 0.96, P =
. 05). Berarti (± S.E.M). C: Menunjukkan korelasi positif antara potensi antibiotik dan zona
inhibisi pengukuran (c.c=0.84, p mengatakan 0,05). Berarti (± S.E.M). D: korelasi positif ditampilkan
antara berbagai patogen inhibisi dan indeks penghambatan patogen (c.c=-0.20, * P = 05)
3.3 deteksi DNA Plasmid
untuk menentukan unsur-unsur molekul yang mungkin terlibat dalam produksi antibiotik dalam situs
Tanah tertentu mengisolasi, kita mencari keberadaan DNA plasmid dan menemukannya di beberapa perumahan
tanah berasal dari APSs, sebagai Y14p, Y29p, Y40p, Y17p, Y63p, dan Y67p (Fig. 2a). Ini
isolat dipamerkan P.I.I secara signifikan lebih besar daripada bebas plasmid APSs (Fig. 2b). Empat plasmid
bantalan APSs (Y14p, Y17p, Y63p, dan Y67p) menunjukkan pertumbuhan yang substansial penindasan
terhadap L. monocytogenes dan S. Aureus, tetapi penghambatan terluas ditunjukkan
terhadap P. fluorescens oleh 83.3% pDNA-bantalan APSs (Tabel 3). Sebaliknya, hanya 22.2%
isolat gratis pDNA (Y13, Y16a, dan L59) mampu menghambat P. fluorescence. PDNA beberapa
gratis isolat (yaitu Y44, Y13, Y64b, Y16, Y16a, Y64a), namun ditampilkan kuat penghambatan
properti terhadap S. sciuri, atau S. cerevisiae, tetapi mayoritas (55.6%; yaitu Y44, Y16,
Y16a, Y49, Y64a) menunjukkan penghambatan terhadap K. kristinae (Tabel 3).
kemampuan perumahan pDNA tinggal di tanah mengisolasi untuk menghambat keduanya gram-negatif dan
positif bakteri menunjukkan mereka miliki oleh, juga sebagai aciduric dan kromat-seperti
properti, memproduksi antibiotik mirip β-laktam, 6-anilinouracils (AUs), tetracyclic,
oxytertracycline atau lain polycyclic senyawa potensi yang pasti hadir untuk aplikasi penyakit bawaan makanan dan nosokomial [17]. Umumnya, bebas pDNA APSs menunjukkan
sifat antibiotik yang ampuh melawan S. sciuri dan K. kristinae, gram-positif fakultatif
anaerobes yang normal penduduk jaringan manusia dan telah dikutip menyebabkan
berbagai macam penyakit menular [18]. Di antara yang disaring patogen adalah S. aureus,
patogen yang bertanggung jawab untuk pengembangan aureus (MRSA) Methicillin-Resistant Staphulococcus,
yang telah diidentifikasi sebagai penyebab paling umum penyakit nosokomial, sering
diperoleh di luar rumah tangga dan dibawa kembali ke komunitas residensial dengan kembali
pasien [19]. Dalam penelitian kami, lebih dari 66,6% dari perumahan plasmid-borne isolat dianugerahkan
kualitas penghambatan terhadap S. aureus (Tabel 3), menunjukkan bahwa tanah perumahan bisa
substansial berkembang reservoir untuk memproduksi antibiotik mengisolasi, terus-menerus beradaptasi
patogen yang Diperoleh dari berbagai lingkungan dan kemudian mengembangkan novel dan
spesifik antibiotik melawan tahan strain.
gambar 2A. Profil DNA plasmid dan patogen indeks penghambatan terisolasi tanah
Mikroorganisme menghasilkan antibiotik
A: mengisolasi Y14 (), Y17, Y29, Y40, Y63, dan Y67 (jalur #3, 7, 8, 1 1, 12, dan 15, masing-masing)
mengungkapkan kehadiran pDNA,
3.4 filogenetik hubungan dari ampuh antibiotik memproduksi
mikroorganisme
mereka terutama ZOI strategis dan mereka konsistensi dalam inhibisi patogen, tiga
tanah mengisolasi Y14p, Y16, dan Y40p yang berusaha untuk mengidentifikasi menggunakan 16S rRNA berbasis
urutan analisis filogenetik hubungan. Urutan-urutan parsial 956 bp, 958 bp,
dan 953 bp Y14p, Y16 dan Y40, masing-masing, dibandingkan dengan kerabat yang terdekat dari
GenBank dan Ribosomal Database proyek (RDP) rilis 10
(http://rdp.cme.msu.edu/index.jsp). Urutan analisis 16S rRNA mengungkapkan
mengisolasi Y14p, Y16, dan Y40 menjadi erat berhubungan dengan keluarga Enterobacteriaceae,
Xanthomonadaceae, dan Bacillaceae, masing-masing (Fig. 3a-c). Semua organisme tiga (i.e.
Y14p, Y16, dan Y40) menunjukkan kedekatan dengan genus Enterobacter sp.
Stenotrophomonas sp., dan Bacillus sp., masing-masing (Fig. 3a-c). Lebih lanjut, urutan untuk
Y14p, Y16 dan Y40 yang disimpan dalam database GenBank di bawah nomor aksesi
JQ956432, JQ956433 dan JX121858, masing-masing. Profil GenBank dan RDP
mengisolasi Y16 erat cocok bahwa dari Stenotrophomonas sp., gram negatif wajib menarik aerobes
ditemukan dalam air dan tanah. Mereka yang dikutip sebagai pembawa pDNA dan telah dicatat untuk mereka
kuat resistensi terhadap antibiotik serta peran mereka dalam nosokomial infe

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

3. HASIL DAN PEMBAHASAN
3.1 Isolasi Antibiotik-Memproduksi Mikroorganisme
The skrining utama tanah perumahan dan rekreasi menghasilkan total 71 dan 9
APS menjanjikan dengan pertumbuhan sifat penghambatan, masing-masing
Tabel 1. Hitung tanah perumahan dan rekreasi isolat menampilkan kapasitas antibioticproducing di berbagai skrining tahap
Semua isolat dipilih dari skrining utama itu kembali disaring oleh PCPM. Sebagian besar isolat
diperoleh dari situs rekreasi menunjukkan kapasitas penghambatan memadai terhadap semua sembilan belas
mikroorganisme patogen selama pemutaran sekunder. Hanya satu isolat (L59) dari
situs rekreasi tubi dipamerkan sifat penghambatan pertumbuhan, menghambat B. cereus, C.
albicans, P. fluoresensi, S. aureus, dan S. zooepidemicus pada media NA (Tabel 2). The
berbagai isolat dari sampel tanah perumahan, yaitu 11 (21,2%), 4 (33,3%), dan 4
(57,5%) isolat, ditampilkan pertumbuhan yang cukup sifat penghambatan pada NA, PDA, dan TSA
media, masing-masing (Tabel 1) . Tanah rekreasi tidak mengungkapkan isolat dengan pertumbuhan penghambatan
properti di TSA atau PDA menengah, dan secara keseluruhan menghasilkan hampir enam kali APS kurang dari
tanah perumahan (Tabel 1, P = .05).
Tabel 2. Tanah isolat menampilkan pertumbuhan yang kuat sifat penghambatan setelah sekunder
pemutaran dengan uji cross-plate terhadap 19 patogen pada tiga media yang berbeda
ATCC
Patogen
Gram
pewarnaan
PDA NA TSA.
Sisanya rekreasi isolat tanah yang diturunkan tunggal (L59) bertahan melalui pemeriksaan ini. Secara keseluruhan,
total 15 berbeda antibiotik-memproduksi isolat dengan potensi penghambatan yang cukup yang
diisolasi dan selanjutnya ditandai. Rekreasi isolat tanah yang diturunkan sisa tunggal
(L59) bertahan melalui pemeriksaan ini. Secara keseluruhan, total 15 antibiotik-produksi yang berbeda
organisme dengan potensi penghambatan yang cukup diisolasi dan selanjutnya ditandai. Selama
penelitian kami, isolat 'kapasitas penghambatan berganti-ganti pada tahap screening yang berbeda. Pada beberapa
tahap mereka ditampilkan kemampuan penekan pertumbuhan terhadap patogen tertentu tetapi hilang atau
beralih kemampuan ini penghambatan terhadap patogen lain selama tahap screening yang berbeda
(Tabel 1-2). Observasi ini mungkin menunjukkan adanya swapping antibioticspecificity sangat spontan yang terlibat dalam sintesis interdependently antibiotik antara isolat tanah dalam sebuah lingkungan mikro yang optimal, dan mendukung penelitian sebelumnya yang menentukan kuat
pengaruh mikroorganisme tetangga di sekitarnya sekresi antibiotik bakteri [13].
3.2 Penilaian Pertumbuhan-Hambat
nilai-nilai individu rata-rata zona inhibisi (Zoi) dari masing-masing isolat dirangkum dalam Tabel
3, dan mengungkapkan Y14 dengan Zoi terbesar (10.16mm), berdemonstrasi menentang patogen K.
kristinae pada media PDA. Isolat Y13 dipamerkan perimeter penghambatan yang maksimal terhadap S.
marcescess (9.40mm). Y14p dan Y44 ditampilkan perimeter penghambatan maksimum mereka melawan
K. kristinae (10.16mm dan 2.01mm, masing-masing). Y16 dan Y67p ditampilkan mereka terbesar
perimeter penghambatan terhadap L. monocytogenes (2.54mm dan 2.54mm). Y16a mengungkapkan
Zoi maksimal terhadap O. anthropi (2.54mm). Isolat Y17p dipamerkan maksimum
perimeter penghambatan terhadap P. fluoresensi, C. albicans dan S. aureus (2.54mm, 2,54 mm,
dan 2,54 mm). Y29p ditampilkan penghambatan zona terbesar terhadap P. fluoresensi dan S.
aureus (2.54mm dan 2.54mm). Demikian pula, Y39 memiliki hambat perimeter terbesar terhadap
En. saccharolyticus (2.29mm). Y40p terbesar penghambatan perimeter melawan P.
fluoresensi (2.54mm). Isolat Y49 dan L59 maksimum perimeter penghambatan itu
terhadap S. aureus (6,35 mm dan 6,10 mm). Y63p terbesar Zoi melawan S.
zooepiderimicus (3.81mm). Y64a maksimum Zoi melawan C. albicans (2.54mm). Y64b
Zoi terbesar adalah melawan L. monocytogenes (5,08 mm).
Selanjutnya, APSS potensi antibiotik (AP) dan jangkauan rata-rata penghambatan pertumbuhan
mikroorganisme patogen ditentukan. Isolat Y17p andY14p menunjukkan
terbesar AP, yang diamati terhadap P. fluoresensi (AP = 5) dan M. luteus (AP =
5), masing-masing. Y63p namun memiliki jangkauan terluas penghambatan patogen, mengungkapkan
kapasitas penekan pertumbuhan terhadap lebih dari 60% dari disaring klinis relevan
patogen L. monocytogenes, En. saccharolyticus, K. kristinae, K. faecalis, M. luteus, O.
anthropi, S. cerevisiae, S. aureus, S. scuiri, dan S. zooepiderimicus. Di antara terisolasi
mikroorganisme, isolat Y14p, Y63p, dan Y13 memiliki PII terbesar (yaitu 35,3, 26,1, dan
25,3), masing-masing, sebagai kombinasi dari jangkauan mereka penghambatan patogen, AP, dan Zoi
adalah yang terbesar (Gambar 1a) . Isolat Y44, Y39 dan menunjukkan AP terlemah,
masing-masing. Tidak ada isolat mampu menghambat K. pneumoniae, K. oxytoca, dan S. thermophilus.
Sebagai antisipasi, ada korelasi positif antara AP, PII (cc = 0,85, P = .05), Zoi
(cc = 0,92, P = .05 ), dan berbagai patogen inhibisi (Gambar 1d, cc = 0,76, P = .05) (Gambar 1
b, c
.. Gambar 1 Berarti patogen indeks penghambatan tanah isolat
A: Beberapa tanah isolat menunjukkan peningkatan indeks patogen rata-rata . B: korelasi positif yang ditampilkan
antara potensi antibiotik APS 'dan Pathogenic Hambat Indeks (koefisien korelasi = 0,96, P =
.. .05) Berarti (± SEM) C: korelasi positif ditunjukkan antara potensi antibiotik dan zona
pengukuran inhibisi (cc = 0,84 ., p> 0,05) rata-rata (± SEM) D:. korelasi positif yang ditampilkan
antara kisaran penghambatan patogen dan Hambat Indeks Pathogenic (cc = -0.20, * P = .05)
3.3 Deteksi Plasmid DNA
Untuk menentukan unsur-unsur molekul yang mungkin terlibat dalam produksi antibiotik dalam situs
tanah spesifik isolat, kami mencari keberadaan DNA plasmid dan menemukannya di beberapa perumahan
tanah yang diturunkan APSS, ditunjuk sebagai Y14p, Y29p, Y40p, Y17p, Y63p, dan Y67p (Gambar 2a). Ini
isolat menunjukkan PII signifikan lebih besar daripada plasmid bebas APSS (Gambar 2b). Empat plasmid
bantalan APSS (Y14p, Y17p, Y63p, dan Y67p) menunjukkan penekanan pertumbuhan yang besar
terhadap L. monocytogenes dan S. aureus, tetapi penghambatan luas ditunjukkan
terhadap P. fluorescens dengan 83,3% dari pDNA-bantalan APSS (Tabel 3). Sebaliknya, hanya 22,2% dari
isolat gratis pDNA (Y13, Y16a, dan L59) mampu menghambat P. fluoresensi. Beberapa pDNA
isolat gratis (yaitu Y44, Y13, Y64b, Y16, Y16a, Y64a), namun ditampilkan penghambatan yang kuat
terhadap sifat baik S. sciuri, atau S. cerevisiae, namun sebagian (55,6%, yaitu Y44, Y16,
Y16a, Y49 , Y64a) menunjukkan penghambatan terhadap K. kristinae (Tabel 3).
Kemampuan perumahan tanah-sarang pDNA isolat menghambat kedua gram negatif dan
bakteri positif menunjukkan mereka memiliki neutrophilic, serta aciduric dan kromat seperti
properti, memproduksi antibiotik yang sama untuk β-laktam, 6-anilinouracils (Aus), tetracyclic,
oxytertracycline atau senyawa polisiklik lainnya yang tentunya berpotensi hadir untuk bawaan makanan dan penyakit nosokomial aplikasi [17]. Umumnya, pDNA bebas APSS menunjukkan
sifat antibiotik ampuh melawan S. sciuri dan K. kristinae, gram-positif fakultatif
anaerob yang merupakan penghuni normal jaringan manusia dan telah dikutip untuk menyebabkan
berbagai penyakit menular [18]. Di antara patogen disaring adalah S. aureus, yang
patogen yang bertanggung jawab untuk Methicillin Resistant-Staphulococcus aureus (MRSA) pembangunan,
yang telah diidentifikasi sebagai penyebab paling umum dari penyakit nosokomial, sering
diperoleh di luar rumah tangga dan dibawa kembali ke komunitas perumahan dengan mengembalikan
pasien [19]. Dalam penelitian kami, lebih dari 66,6% dari perumahan isolat plasmid-borne diberikan
kualitas penghambatan terhadap S. aureus (Tabel 3), menunjukkan bahwa tanah perumahan bisa menjadi
waduk secara substansial berkembang untuk isolat antibiotik memproduksi, terus-menerus beradaptasi dengan
patogen yang diperoleh dari berbagai lingkungan dan kemudian mengembangkan novel dan
antibiotik spesifik terhadap strain resisten.
Gambar. 2A. Profil plasmid DNA dan indeks Hambat patogen tanah-terisolasi
antibiotik memproduksi mikroorganisme
A: (a) Isolat Y14, Y17, Y29, Y40, Y63, Y67 dan (Lanes # 3, 7, 8, 1 1, 12, dan 15, masing-masing)
mengungkapkan pDNA kehadiran,
3,4 filogenetik Hubungan of Potensi Antibiotik-Memproduksi
Mikroorganisme
Karena perimeter Zoi utama mereka dan konsistensi mereka dalam penghambatan patogen, tiga
isolat tanah Y14p, Y16, dan Y40p yang berusaha untuk mengidentifikasi menggunakan 16S rRNA berdasarkan
analisis urutan filogenetik hubungan. Urutan parsial dari 956 bp, 958 bp,
dan 953 bp dari Y14p, Y16, Y40 dan, masing-masing, dibandingkan dengan kerabat terdekat dari
Proyek database GenBank dan ribosomal (RDP) merilis 10
(http://rdp.cme.msu. edu / index.jsp). Analisis urutan 16S rRNA mengungkapkan
isolat Y14p, Y16, Y40 dan harus terkait erat dengan keluarga Enterobacteriaceae,
Xanthomonadaceae, dan Bacillaceae, masing-masing (Gambar 3a-c). Ketiga organisme (yaitu
Y14p, Y16, Y40 dan) menunjukkan dekat dengan genus Enterobacter sp.
Stenotrophomonas sp., dan Bacillus sp., masing-masing (Gambar 3a-c). Selanjutnya, urutan untuk
Y14p, Y16, Y40 dan diendapkan dalam database GenBank di bawah nomor aksesi
JQ956432, JQ956433, dan JX121858, masing-masing. The GenBank dan RDP profil
isolat Y16 erat cocok bahwa Stenotrophomonas sp., aerob obligat gram negatif
yang ditemukan di air dan tanah. Mereka disebut-sebut sebagai operator pDNA dan telah dicatat untuk mereka
resistensi yang kuat terhadap antibiotik serta peran mereka dalam infe nosokomial