DISKUSIKami Metode penentuan absolu

DISKUSI

Kami Metode penentuan absolut situs stoichiometry unbiased menyediakan wawasan ini penting functionally protein properti untuk ribuan basally phosphorylated situs. Pendekatan ini hanya memerlukan ukuran dari satu rasio dalam satu percobaan untuk ODPs. The stoichiometry hubungan adalah mudah untuk menentukan untuk sendirian phosphorylated Peptida. Menentukan stoichiometries untuk melipatgandakan phosphorylated Peptida lebih rumit dan mungkin tidak akurat mencerminkan nilai di situs individu, tapi hasilnya masih mewakili dihuni tingkat menyangkut urutan wilayah diperlihatkan. Mereka harus dipertimbangkan untuk mewakili maksimum potensi asing di setiap situs. Dari 5,033 stoichiometry pengukuran kami mengumpulkan 1,017, yang berasal dari Peptida di beberapa situs yang hadir.

Kami rata-rata kita stoichiometry pengukuran terpisah dari tiga yeast budaya. The s.d dari pengukuran ini adalah ~6%. Ini berarti bahwa metode yang tidak cocok untuk membedakan perbedaan kecil stoichiometry tetapi dapat digunakan untuk mengklasifikasikan situs ke setidaknya 5-10 kategori meningkatkan stoichiometry. Juga, dalam suasana validasi absolut dari sepuluh negara asing untuk situs AQUA.sup.13 oleh [], kesepakatan antara AQUA stoichiometries dan phosphatase-based metode yang kuat.

Sebuah khusus stoichiometry kasus penuh asing, yang meramalkan berdasarkan kinase aktivitas kecil dan/atau fosfatase aktivitas pada situs. Banyak cyclin-dependent kinase situs telah diperlihatkan untuk mencapai penuh asing di bawah kondisi mitotic (9, 19). Namun, kita mengumpulkan kita pengukuran dari asinkron yeast di mana sebagian besar sel tidak akan ada di mitosis. Dengan demikian, kebanyakan sasaran CDK (mitotic situs) akan terdeteksi pada rendah stoichiometry. Kami menemukan bahwa situs yang ditentukan dalam studi (7) yang akan substrates untuk Cdk1 dan bertumpang tindih dengan peralatan kami (95) berisi situs yang sama sebagai stoichiometries distribusi dari seluruh phosphoproteome dengan banyak tinggi dan rendah stoichiometry acara (berarti = 40.6%; Supplementary Fig. 4 dan Supplementary Tabel 7). Hal ini menunjukkan bahwa kebanyakan situs' 'mitotic sebenarnya phosphorylated tahapan lain selama siklus sel. Mereka mungkin memiliki tambahan, nonmitotic peran, yang kemudian kewalahan atau repurposed selama mitosis.

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

DISKUSIKami Metode penentuan absolut situs stoichiometry unbiased menyediakan wawasan ini penting functionally protein properti untuk ribuan basally phosphorylated situs. Pendekatan ini hanya memerlukan ukuran dari satu rasio dalam satu percobaan untuk ODPs. The stoichiometry hubungan adalah mudah untuk menentukan untuk sendirian phosphorylated Peptida. Menentukan stoichiometries untuk melipatgandakan phosphorylated Peptida lebih rumit dan mungkin tidak akurat mencerminkan nilai di situs individu, tapi hasilnya masih mewakili dihuni tingkat menyangkut urutan wilayah diperlihatkan. Mereka harus dipertimbangkan untuk mewakili maksimum potensi asing di setiap situs. Dari 5,033 stoichiometry pengukuran kami mengumpulkan 1,017, yang berasal dari Peptida di beberapa situs yang hadir.Kami rata-rata kita stoichiometry pengukuran terpisah dari tiga yeast budaya. The s.d dari pengukuran ini adalah ~6%. Ini berarti bahwa metode yang tidak cocok untuk membedakan perbedaan kecil stoichiometry tetapi dapat digunakan untuk mengklasifikasikan situs ke setidaknya 5-10 kategori meningkatkan stoichiometry. Juga, dalam suasana validasi absolut dari sepuluh negara asing untuk situs AQUA.sup.13 oleh [], kesepakatan antara AQUA stoichiometries dan phosphatase-based metode yang kuat.Membahas khusus stoikiometri kasus penuh asing, yang meramalkan berdasarkan kinase aktivitas kecil dan/atau fosfatase aktivitas pada situs. Banyak kinase bergantung siklin situs tlah diperlihatkan untuk mencapai penuh asing di bawah kondisi mitosis (9, 19). Namun, kita mengumpulkan kita pengukuran dari asinkron ragi di mana sebagian besar sel tidak akan ada di mitosis. Dengan demikian, kebanyakan sasaran CDK (mitosis situs) akan terdeteksi pada rendah stoikiometri. Kami menemukan bahwa situs yang ditentukan dalam studi (7) yang akan substrat untuk Cdk1 dan bertumpang tindih dengan peralatan kami (95) berisi situs yang sama sebagai stoichiometries distribusi dari seluruh phosphoproteome dengan banyak tinggi dan rendah stoikiometri acara (berarti = 40,6%; Dan tambahan gambar 4 7 Tabel tambahan). Hal ini menunjukkan bahwa kebanyakan situs' ' mitosis sebenarnya phosphorylated tahapan lain selama siklus sel. Mereka yang mungkin memiliki tambahan, nonmitotic peran, yang kemudian terjadi kewalahan atau repurposed selama mitosis.

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

DISKUSI

Kami Metode Penentuan absolut situs stoikiometri berisi Wawasan MENYEDIAKAN Penyanyi Penting fungsional protein Properti untuk review RIBUAN basally terfosforilasi situs. Pendekatan Penyanyi Hanya memerlukan ukuran Dari Satu rasio hearts Satu Percobaan untuk review ODPs. Stoikiometri Hubungan Adalah Mudah untuk review menentukan untuk review Sendirian terfosforilasi Peptida. Menentukan stoichiometries untuk review melipatgandakan terfosforilasi Peptida LEBIH rumit Dan mungkin TIDAK Akurat mencerminkan Nilai di situs individu, TAPI hasilnya Masih mewakili dihuni Tingkat menyangkut Urutan wilâyah diperlihatkan. Mereka Harus dipertimbangkan untuk review mewakili Maksimum Potensi Asing di SETIAP situs. Dari 5.033 stoikiometri Pengukuran Kami mengumpulkan 1017, Yang berasal Dari Peptida di beberapa situs Yang Hadir.

Kami rata-rata kitd stoikiometri Pengukuran terpisah Dari Tiga ragi budaya. The sd Dari Pengukuran Penyanyi Adalah ~ 6%. Penyanyi Berarti bahwa Metode Yang TIDAK Cocok Untuk membedakan Perbedaan Kecil stoikiometri tetapi can be digunakan untuk review mengklasifikasikan situs Ke setidaknya 5-10 kategori meningkatkan stoikiometri. Also, hearts suasana validasi absolut Dari Sepuluh gatra Asing untuk review situs AQUA.sup.13 Oleh [], Kesepakatan ANTARA AQUA stoichiometries Dan berbasis fosfatase Metode Yang KUAT.

SEBUAH KHUSUS stoikiometri KASUS Penuh Asing, Yang meramalkan AKTIVITAS kinase berdasarkan Kecil Dan / ATAU fosfatase AKTIVITAS PADA situs. Banyak cyclin-dependent kinase situs has diperlihatkan untuk review mencapai Penuh Asing di Bawah Kondisi mitosis (9, 19). Namun, kitd mengumpulkan kitd Pengukuran Dari asinkron ragi di mana sebagian gede sel TIDAK akan ADA di mitosis. Mencari Google Artikel demikian, kebanyakan CDK Sasaran (mitosis situs) akan terdeteksi PADA Rendah stoikiometri. Kami menemukan bahwa situs Yang ditentukan hearts Studi (7) Yang akan substrat untuk review Cdk1 Dan bertumpang tindih DENGAN Peralatan Kami (95) Berisi situs Yang sama sebagai stoichiometries Distribusi Dari Seluruh phosphoproteome DENGAN Banyak Tinggi Dan Rendah stoikiometri Acara (Berarti = 40,6%; Tambahan Gambar . 4 dan Tambahan Tabel 7). Hal Penyanyi menunjukkan bahwa kebanyakan situs '' mitosis sebenarnya Tahapan terfosforilasi berbaring selama SIKLUS sel. Mereka mungkin memiliki Tambahan, nonmitosis berusia Peran, which are ATAU kewalahan repurposed selama mitosis.