metode Dahal et al. (1997) dan Cooter et al.
(2000) dengan modifikasi dari varietas padi dan umur
bibit untuk memberi makan wereng tersebut. Kultivar rentan
Cisadane dipilih untuk memberi makan wereng tersebut. Satu
bibit minggu-lama Cisadane ditanam di plastik
boxs 3x7x14 cm dan kemudian ditempatkan pada
kotak pemeliharaan 40x40x40 cm untuk membesarkan
N. virescens.
Identifikasi N. virescens Pemancar aktif.
Identifikasi N. virescens pemancar aktif yang
dilakukan melalui prosedur pengujian transmisi
menurut Dahal et al. (1997). Laki-laki dewasa dari
wereng yang penuh beras yang telah terinfeksi
oleh virus tungro selama tiga hari untuk mengambil makan akuisisi.
Setelah makan akuisisi, wereng itu penuh
individual pada bibit yang sehat untuk inokulasi makan
selama tiga hari. Setelah makan inokulasi, bibit
ditanam secara individual pada pot 6 cm diameter.
The N.virescens pemancar aktif yang
ditentukan oleh ditermining kemampuan mereka untuk mengirimkan tungro
virus setelah makan akuisisi, sesuai dengan kriteria
dari Ling (1972). Kemampuan N. virescens untuk mengirimkan
virus didasarkan pada kriteria Evaluasi Standar
System (SES), dengan skor 3, yaitu memperpendek dari
1-10% dari daun atas, bibit yang abnormal oleh dipersingkat
pertumbuhan, tapi tidak ada kekuningan daun (IRRI, 1996). The
N. virescens pemancar aktif yang telah
diidentifikasi disimpan di 90% alkohol dan digunakan sebagai
sampel DNA ekstraksi.
Ekstraksi DNA. Prosedur RAPD-PCR
dilakukan melalui tiga langkah utama, yaitu DNA
ekstraksi, amplifikasi PCR dan visualisasi DNA.
Langkah pertama RAPD-PCR adalah penyusunan
template DNA target. N. virescens aktif
pemancar laki-laki digunakan untuk mengisolasi DNA template.
Pria N. virescens yang digunakan sebagai sampel karena
tubuh mereka lebih kecil dan isi protein rendah, jadi
tidak ikut campur dalam PCR amplifikasi. Genom DNA awalnya
diekstraksi dengan metode modifikasi dari Hidayat et al.
(1996). Homogenizaton tiga wereng hijau,
N. virescens pemancar aktif dilakukan dalam
tabung microcentrifuge menggunakan micro-alu plastik. Seluruh
serangga dimaserasi dalam 125 ml buffer ekstraksi
(2% CTAB, 1.4 M NaCl, 20 mM EDTA, 100 mM TrisHCl
pH 8, 0) dan diinkubasi pada 60 ° C selama 30 menit. Kemudian
ditambahkan satu volume kloroform: isoamil alkohol
(24: 1) dan dihomogenisasi dengan vortex. Selanjutnya,
sampel disentrifugasi selama 5 menit pada 800 rpm.
Supernatan dipindahkan ke tabung baru, ditambahkan
10 ml 3 M NaOAc dan 250 ml etanol absolut,
dari supernatan diinkubasi pada -20 ° C selama 30
menit dan disentrifugasi pada 11.500 rpm selama 15 menit. Setelah
sentrifugasi, supernatan dibuang dan pelet
dicuci dengan 200 ml 0,2 M larutan amonium
asetat dalam etanol 70% dan disentrifugasi pada 11.500 rpm
selama 2 menit. Etanol dibuang dan pelet itu
dikeringkan dalam pompa vakum selama 10 menit. Pelet kemudian
resuspended dalam 10 ml air steril dan disimpan pada
-20 ° C. Konsentrasi DNA dari masing-masing sampel
diukur dengan menggunakan spektrofotometer, sedangkan kualitas
DNA diperiksa dengan elektroforesis pada 1,4%
agarose.
DNA amplifikasi. The RAPD-PCR amplifikasi
adalah langkah untuk memimpin band DNA dari sampel diidentifikasi.
RAPD-PCR amplifikasi langkah adalah memimpin pita DNA
dari sampel diidentifikasi. Amplifikasi template DNA
dari N. virescens dilakukan seperti yang dijelaskan oleh Hidayat
et al., (1996). Tiga primer acak yang dipilih, yaitu
OPB 01 (GTT TCG CTC C); OPB10 (CTG CTG GGA
C), dan OPC08 (GGT ACC TGG G), barang yang digunakan untuk
memperkuat DNA template. Semua primer yang
umum digunakan untuk memperkuat serangga (Loxdale & Lushai,
1998). PCR dilakukan di 25 ml reaksi Volume
campuran. Campuran reaksi yang terkandung 18,8 H2O ml,
2,5 ml Buffer MgCl2, 0,5 ml campuran dNTP 10 mM, 1μl
acak primer 10 pM, 0,2 ml Taq DNA polimerisasi
5 u / ml, dan 2 ml DNA template. Tabung yang mengandung reaksi
campuran yang diolah menjadi PCR Cycler Thermal
mesin. Reaksi amplifikasi dilakukan dengan
menggunakan GenAmp PCR 9700 thermo pengendara sepeda diprogram
untuk menjalankan prosedur berikut: sebuah awal denaturasi 1
siklus pada 95 ° C selama 5 menit; 45 siklus yang terdiri dari masing-masing
langkah denaturasi pada 94 ° C selama 1 menit; langkah anil
pada 36 ° C selama 1 menit; ekstensi pada 72 ° C selama 2 menit dan
akhir perpanjangan / ekstensi pada 72 ° C selama 5 menit. The
produk masing-masing PCR divisualisasikan dalam menjalankan
elektroforesis di 1,4% agarose gel pada 60 V selama 7 jam di
TAE penyangga. Gel yang bernoda menggunakan ethidium
bromide. Hasil yang diamati dalam
cahaya transillumination UV (UV) dan photodocumented.
Analisis Data. Analisis data dilakukan pada
variabilitas perbedaan virescens N. berasal dari
daerah endemik dan non-endemik dipelajari. Gel
elektroforesis produk, setelah difoto sedang
dianalisis untuk kehadiran kriteria visual. Pita DNA
profil dari N. virescens pemancar aktif dari endemik
dan non endemik diberi kode biner dengan kriteria visual yang
kehadiran (1) dan tidak adanya (0) band untuk setiap fragmen
ukuran ditemukan di dasar yang berbeda, tetapi hanya kuat dan
band yang konsisten dianggap. Pola pita
Sedang diterjemahkan, harap tunggu..
