Sebuah skala besar metode untuk men

Sebuah skala besar metode untuk mengukur absolut protein Fosforilasi stoichiometrics
Ronghu Wu, Wilhelm Haas, Noah Dephoure, Edward L. Huttlin, Bo Zhai and Mathew E. Sowa
Nature Methods. 8.8 (Aug. 2011): p677. From InfoTrac Arts Collection 2017.
DOI: http://dx.doi.org/10.1038/NMETH.1636
Copyright: COPYRIGHT 2011 Nature Publishing Group
http://www.nature.com/nmeth/index.html
Abstraksi:

The fungsional peran protein Fosforilasi dipengaruhi oleh para stoichiometry fraksional. Dengan demikian, strategi yang komprehensif untuk mempelajari Fosforilasi dinamika harus memasukkan penilaian dari situs stoichiometry. Di sini kita laporan terpadu metode yang mengandalkan fosfatase perlakuan dan stable-isotope melabelkan untuk menentukan absolut stoichiometries protein Fosforilasi dalam skala besar. Pendekatan ini memerlukan ukuran yang hanya satu rasio terkait phosphatase-treated dan mock-treated sampel. menggunakan strategi ini kita stoichiometries ditentukan untuk Fosforilasi 5,033 situs dalam buku analisis dari Saccharomyces cerevisiae tumbuh sepanjang mid-log tahap. Kami divalidasi stoichiometries sepuluh yang diwakili di situs yang penuh rentang nilai diperoleh sintetis menggunakan phosphopeptides dan perjanjian yang ditemukan. bioinformatics, kami menggunakan mencirikan kelompok biologis properti terkait dengan Fosforilasi jauh berbeda dengan situs stoichiometries absolut.
Teks Penuh:

bolak-balik protein Fosforilasi memiliki peranan yang penting dalam sistem biologis dan terlibat dalam hampir setiap fungsi seluler. Massa spectrometry-based proteomics dapat digunakan untuk secara global anggap ini luas post-translational modifikasi dan telah banyak meninjau (). 1-3 Kombinasi dengan stable-isotope melabelkan, massa spectrometry-based proteomics telah menghasilkan datasets dengan skala besar kuantifikasi dari Fosforilasi perubahan antara sel negara (1, 4, 5). Saat ini memberikan sebuah skala perbandingan informatif tampilan protein-phosphorylation lanskap (1), 6-9. Namun, biologis mereka penafsiran itu rumit. Jika perbedaan protein kelimpahan ini, perubahan dalam perkembangan sebuah situs Fosforilasi mengakibatkan dikenal relatif stoichiometry mengubah (10), tetapi perubahan absolut fraksional asing tetap tak diketahui. Sebagai contoh, twofold downregulation dari situs stoichiometry dapat hasil dari masing-masing fraksional dihuni perubahan dari 0.2% hingga 0.1% atau 100% hingga 50%, yang kemungkinan mewakili pada dasarnya berbeda seluler strategi. Oleh karena itu, muncul penting untuk menilai Fosforilasi absolut situs asing pada skala proteome dengan benar dan memahami fungsional secara komprehensif yang penting.

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

Membahas skala besar metode untuk mengukur absolut protein Fosforilasi stoichiometricsRonghu Wu, Wilhelm Haas, Noah Dephoure, Edward L. Huttlin, Bo Zhai dan Mathew E. SowaMetode alam. 8.8 (Aug. 2011): p677. Dari InfoTrac seni koleksi 2017.DOI: http://dx.doi.org/10.1038/NMETH.1636Copyright: Hak cipta 2011 Investigatorhttp://www.Nature.com/nmeth/index.htmlAbstraksi: Fungsional peran protein Fosforilasi dipengaruhi oleh para stoikiometri fraksional. Dengan demikian, strategi yang komprehensif untuk mempelajari Fosforilasi dinamika harus memasukkan penilaian dari situs stoikiometri. Di sini kita akan terpadu metode yang mengandalkan fosfatase perlakuan dan melabelkan isotop stabil untuk menentukan absolut stoichiometries protein Fosforilasi dalam skala besar. Pendekatan ini memerlukan ukuran yang hanya satu rasio terkait diperlakukan fosfatase dan diperlakukan mock-sampel. menggunakan strategi ini kita stoichiometries ditentukan untuk Fosforilasi 5,033 situs dalam buku analisis dari Saccharomyces cerevisiae tumbuh sepanjang pertengahan log tahap. Kami divalidasi stoichiometries sepuluh yang diwakili di situs yang penuh rentang nilai diperoleh sintetis menggunakan dapat dan perjanjian yang ditemukan. Bioinformatika, kami menggunakan mencirikan kelompok biologis properti terkait dengan Fosforilasi jauh buah dengan situs stoichiometries absolut.Teks Penuh: bolak-balik protein Fosforilasi memiliki peranan yang penting dalam sistem biologis dan terlibat dalam hampir setiap fungsi seluler. Massa spectrometry-based proteomics dapat digunakan untuk secara global anggap ini luas post-translational modifikasi dan telah banyak meninjau (). 1-3 Kombinasi dengan stable-isotope melabelkan, massa spectrometry-based proteomics telah menghasilkan datasets dengan skala besar kuantifikasi dari Fosforilasi perubahan antara sel negara (1, 4, 5). Saat ini memberikan sebuah skala perbandingan informatif tampilan protein-phosphorylation lanskap (1), 6-9. Namun, biologis mereka penafsiran itu rumit. Jika perbedaan protein kelimpahan ini, perubahan dalam perkembangan sebuah situs Fosforilasi mengakibatkan dikenal relatif stoichiometry mengubah (10), tetapi perubahan absolut fraksional asing tetap tak diketahui. Sebagai contoh, twofold downregulation dari situs stoichiometry dapat hasil dari masing-masing fraksional dihuni perubahan dari 0.2% hingga 0.1% atau 100% hingga 50%, yang kemungkinan mewakili pada dasarnya berbeda seluler strategi. Oleh karena itu, muncul penting untuk menilai Fosforilasi absolut situs asing pada skala proteome dengan benar dan memahami fungsional secara komprehensif yang penting.

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

SEBUAH Skala gede Metode untuk review mengukur absolut protein fosforilasi stoichiometrics
Ronghu Wu, Wilhelm Haas, Noah Dephoure, Edward L. Huttlin, Bo Zhai dan Mathew E. Sowa
Metode Alam. 8.8 (Agustus 2011): p677. Dari InfoTrac Arts Collection 2017.
DOI: http://dx.doi.org/10.1038/NMETH.1636
Copyright: HAK CIPTA 2011 Sifat Publishing Group
http://www.nature.com/nmeth/index.html
Abstraksi:

The Fungsional Peran protein fosforilasi dipengaruhi Oleh para stoikiometri fraksional. Mencari Google Artikel demikian, Pengembangan strategi Yang komprehensif untuk review mempelajari fosforilasi Dinamika Harus memasukkan PENILAIAN Dari situs stoikiometri. Here kitd Laporan terpadu Metode Yang mengandalkan fosfatase perlakuan Dan-isotop stabil melabelkan untuk review menentukan absolut stoichiometries protein fosforilasi hearts skala Anda gede. Pendekatan Penyanyi memerlukan ukuran Yang Hanya Satu rasio Berlangganan fosfatase-diperlakukan Dan mock-diperlakukan sampel. using Pengembangan strategi Penyanyi kitd stoichiometries ditentukan untuk review fosforilasi 5033 situs hearts buku analisis Dari Saccharomyces cerevisiae Tumbuh Sepanjang pertengahan log Tahap. Kami divalidasi stoichiometries Sepuluh Yang diwakili di situs Yang Penuh Rentang Nilai TIMAH sintetis using phosphopeptides Dan perjanjian Yang ditemukan. bioinformatika, kami using mencirikan Kelompok biologis Properti Berlangganan DENGAN fosforilasi JAUH BERBEDA DENGAN situs stoichiometries absolut.
Teks Penuh:

Bolak-balik protein fosforilasi memiliki Peranan Yang Penting hearts Sistem biologis Dan terlibat hearts hampir SETIAP fungsi fungsi seluler. Proteomik berbasis spektrometri massa can be digunakan untuk review Beroperasi global yang anggap Penyanyi Luas modifikasi pasca-translasi Dan has Banyak meninjau (). 1-3 Kombinasi DENGAN melabelkan-isotop stabil, massa berbasis spektrometri proteomik has dataset menghasilkan DENGAN skala Anda gede kuantifikasi Dari fosforilasi perubahan ANTARA sel gatra (1, 4, 5). Saat Penyanyi memberikan SEBUAH skala Anda PERBANDINGAN Informatif tampilan protein-fosforilasi lanskap (1), 6-9. Namun, biologis mereka penafsiran ITU rumit. JIKA Perbedaan protein Penyanyi kelimpahan, perubahan hearts Perkembangan SEBUAH situs fosforilasi mengakibatkan dikenal Relatif stoikiometri mengubah (10), tetapi perubahan absolut fraksional Asing Tetap tak diketahui. Sebagai contoh, dua kali lipat downregulation Dari situs stoikiometri can be hasil temuan Dari masing-masing fraksional dihuni perubahan Dari 0,2% Hingga 0,1% ATAU 100% Hingga 50%, Yang kemungkinan mewakili PADA dasarnya BERBEDA seluler Pengembangan strategi. Oleh KARENA ITU, Muncul Penting untuk review menilai fosforilasi absolut situs Asing PADA skala Anda proteoma DENGAN Benar Dan Memahami Fungsional Beroperasi komprehensif Yang Penting.