Heat-killed cells of each AFB isola

Heat-killed cells of each AFB isolate were prepared by
mixing *2 loopful of cells (20 ll cell pellet) in 200 ll
dH2O followed by incubation at 80C for 1 h. Heat-killed
AFB samples were used as templates in multiplex polymerase
chain reactions (PCR) for typing of Mycobacterium
genus and region of difference (RD; deletion typing),
according to protocols previously described (Berg et al.
2009). Each isolate characterized as non-tuberculous
mycobacteria (NTM) was sequenced at the 16S rDNA locus
and the sequence was entered in the Basic Local Assignment
Search Tool (BLAST) database at the National Center
for Biotechnology Information (NCBI) and the Ribosomal
Differentiation of Microorganisms (RIDOM) (http://rdna.
ridom.de) database for further identification of species
(Berg et al. 2009). DNA sequencing was performed at
the Animal Health and Veterinary Laboratories Agency
(AHVLA), United Kingdom, using an Applied Biosystems
model 3730 automated capillary DNA sequencer. Isolates
genetically identified by deletion typing as of the M. tuberculosis
complex (MTC) were spoligotyped for further strain
characterization as previously described (Kamerbeek et al.
1997). Spoligotyping data were compared with the Spoligo-
International-Typing (SIT) database (http://www.pasteurguadeloupe.
fr:8081/SITVITDemo/ and http://www.cs.rpi.
edu/*bennek/tbinsight/tblineage.html to match SIT numbers
and lineage classifications. Isolates identified as
M. bovis were compared with spoligotype patterns in the
international M. bovis database (www.mbovis.org). Spoligotype
patterns of all MTC isolates were analysed using
spolTools (http://www.emi.unsw.edu.au/spolTools) (Tang
et al. 2008).

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

Panas yang membunuh sel-sel dari setiap isolat AFB telah dipersiapkan olehpencampuran * 2 loopful sel-sel (20 ll sel pelet) di 200 lldH2O diikuti oleh inkubasi at 80 C untuk 1 h. membunuh panasSampel AFB digunakan sebagai template di multipleks polimerasereaksi berantai (PCR) untuk mengetik Mycobacteriumgenus dan wilayah perbedaan (RD; penghapusan mengetik),Menurut protokol sebelumnya digambarkan (Berg et al.2009). setiap isolat ditandai sebagai non-tuberculousmikobakteri (NTM) diurutkan di 16S rDNA lokusdan urutan dimasukkan dalam penugasan lokal dasarCari alat (ledakan) database di Pusat Nasionaluntuk informasi Bioteknologi (NCBI) dan RibosomalDiferensiasi dari mikroorganisme (RIDOM) (di http://rdna.ridom.de) database untuk lebih lanjut identifikasi spesies(Berg et al. 2009). Sekuensing DNA dapat dilakukan padaHewan laboratorium badan dan kesehatan hewan(AHVLA), Inggris, menggunakan Biosystems diterapkanmodel 3730 otomatis kapiler sequencer DNA. Isolatgenetik diidentifikasi oleh penghapusan mengetik pada M. TBCkompleks (MTC) yang spoligotyped untuk lebih ketegangankarakterisasi seperti sebelumnya dijelaskan (Kamerbeek et al.1997). Spoligotyping data dibandingkan dengan Spoligo -Database internasional-mengetik (SIT) (di http://www.pasteurguadeloupe.fr:8081/SITVITDemo/dan http://www.cs.rpi.edu/*bennek/tbinsight/tblineage.html untuk mencocokkan duduk nomordan klasifikasi silsilah. Isolat yang diidentifikasi sebagaiM. bovis dibandingkan dengan pola spoligotype diInternasional M. bovis database (di www.mbovis.org). Spoligotypepola semua isolat MTC dianalisa dengan menggunakanspolTools (Tang (http://www.emi.unsw.edu.au/spolTools)et al., 2008).

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

Sel panas membunuh setiap isolat AFB disusun oleh
pencampuran * 2 ose penuh sel (pelet sel? 20 ll) di 200 ll
dH2O diikuti dengan inkubasi pada 80? C selama 1 jam. Panas-membunuh
sampel AFB digunakan sebagai template dalam multiplex polymerase
reaksi berantai (PCR) untuk mengetik Mycobacterium
genus dan daerah perbedaan (RD; penghapusan mengetik),
sesuai dengan protokol yang dijelaskan sebelumnya (Berg et al.
2009). Setiap isolat ditandai sebagai non-TB
mycobacteria (NTM) dibariskan pada lokus 16S rDNA
dan urutan ini masuk dalam Dasar Lokal Tugas
Cari Tool (BLAST) basis data di Pusat Nasional
untuk Biotechnology Information (NCBI) dan ribosomal
Diferensiasi Mikroorganisme (RIDOM): (http // rDNA.
database untuk identifikasi lebih lanjut dari spesies ridom.de)
(Berg et al 2009.). Sekuensing DNA dilakukan pada
Hewan Laboratorium Badan Kesehatan Hewan dan
(AHVLA), Inggris Raya, menggunakan Terapan Biosystems
Model 3730 sequencer DNA kapiler otomatis. Isolat
diidentifikasi secara genetik oleh penghapusan mengetik pada tuberkulosis M.
kompleks (MTC) yang spoligotyped untuk beban lebih lanjut
karakterisasi seperti yang dijelaskan sebelumnya (Kamerbeek et al.
1997). Spoligotyping data dibandingkan dengan Spoligo-
International-Typing (SIT) database (http:. //www.pasteurguadeloupe
Fr: 8081 / SITVITDemo / dan http:. //www.cs.rpi
Edu / * bennek / tbinsight / tblineage. html untuk mencocokkan nomor SIT
dan klasifikasi keturunan Isolat diidentifikasi sebagai.
M. bovis dibandingkan dengan pola spoligotype dalam
basis data M. bovis internasional (www.mbovis.org) Spoligotype.
pola semua MTC isolat dianalisis menggunakan
spolTools (http: // www.emi.unsw.edu.au/spolTools) (Tang
et al. 2008).