TORSIONAL ANGLE :• Also called by d

TORSIONAL ANGLE :
• Also called by dihedral angle
•  Describe rotation around covalent bond
•  Conventionally this angle is considered positive if regarded as arising from clockwise rotation
• Variation of the energy of ethane with different dihedral angle.

VAN DER WAALS INTERACTION :
• Common approximation : Lennard-Jones 12-6 potential
EXAMPLE OF THE USE OF MM :
The main application of MM method :
• To calculate geometries and energies of polymers (mainly proteins and nucleic acids)
• To generate the potential energy function for molecular dynamic calculations
• As an aid to organic synthesis
•
STRENGTH AND WEAKNESS OF MM
Strength :
- Fast
- modest computer requirement
- can supply reasonable geometries for semiempiris, ab initio, of DFT calculation

Weakness :
- Not so accurate compare to other method (semiempiris, ab initio or DFT)
- Can’t provide information about the shapes and energies of molecular orbital nor related phenomena such as electronic spectra

LIMITATION OF MM
• Can’t be used to a study processes that include cleavage of covalent bonds such as chemical reactions, protonation states etc.
• Can’t be used to study properties dependent on electron distribution such as spectroscopic data
• Problem with geometry containing metal atoms.
• Has limited precision, significantly lower than QM calculations
• Empirical parameters must be obtained before the method can be used  requires parameterization

Hasil (Bahasa Indonesia) 1:

TORSIONAL SUDUT:• Juga disebut oleh sudut dihedral •  Menggambarkan rotasi di sekitar ikatan kovalen •  Konvensional sudut ini dianggap positif jika dianggap timbul dari searah• Variasi dari energi Etana dengan sudut dihedral berbeda.VAN DER WAALS INTERAKSI:• Pendekatan umum: potensi Lennard-Jones 12-6CONTOH PENGGUNAAN MM:Aplikasi utama MM metode: • Untuk menghitung geometri dan energi polimer (terutama protein dan asam nukleat) • Untuk menghasilkan energi potensial fungsi untuk perhitungan dinamis molekuler • Sebagai bantuan untuk sintesis organik• KEKUATAN DAN KELEMAHAN MM Kekuatan: -Cepat -komputer sederhana persyaratan -dapat menyediakan wajar geometri untuk semiempiris, ab initio, perhitungan DFT Kelemahan: -Tidak begitu akurat dibandingkan metode lain (semiempiris, ab initio atau DFT) -Tidak dapat memberikan informasi tentang bentuk dan energi molekul orbital maupun terkait fenomena seperti spektrum elektronik PEMBATASAN MM • Tidak dapat digunakan untuk proses studi yang meliputi pembelahan kovalen Obligasi seperti reaksi kimia, protonation Serikat dll. • Tidak dapat digunakan untuk mempelajari sifat-sifat yang tergantung pada distribusi elektron seperti data spektroskopi • Masalah dengan geometri yang mengandung atom-atom logam. • Memiliki keterbatasan presisi, secara signifikan lebih rendah daripada QM perhitungan • Empiris parameter harus diperoleh sebelum metode dapat digunakan  memerlukan demikian

Hasil (Bahasa Indonesia) 2:

TORSI SUDUT:
• Juga disebut dengan sudut dihedral
•  Menjelaskan rotasi di sekitar ikatan kovalen
•  konvensional sudut ini dianggap positif jika dianggap timbul dari rotasi searah jarum jam
• Variasi energi dari etana dengan sudut dihedral yang berbeda. VAN DER Waals INTERAKSI: • Umum pendekatan: Lennard-Jones 12-6 potensi CONTOH PENGGUNAAN MM: aplikasi utama dari metode MM: • untuk menghitung geometri dan energi polimer (terutama protein dan asam nukleat) • untuk menghasilkan fungsi energi potensial untuk perhitungan dinamis molekul • sebagai bantuan untuk organik sintesis • KEKUATAN dAN KELEMAHAN MM Kekuatan: - Cepat - persyaratan komputer sederhana - dapat menyediakan geometri yang wajar untuk semiempiris, ab initio, dari DFT perhitungan Kelemahan: - Tidak begitu akurat dibandingkan dengan metode lainnya (semiempiris, ab initio atau DFT) - tidak dapat memberikan informasi tentang bentuk dan energi fenomena orbital atau terkait molekul seperti spektrum elektronik PEMBATASAN MM • tidak bisa digunakan untuk proses studi yang mencakup pembelahan ikatan kovalen seperti reaksi kimia, negara protonasi dll . • tidak bisa digunakan untuk mempelajari sifat tergantung pada distribusi elektron seperti spektroskopi Data • masalah dengan geometri yang mengandung atom logam. • Apakah presisi, secara signifikan lebih rendah dari perhitungan QM terbatas • parameter empiris harus diperoleh sebelum metode dapat digunakan  membutuhkan parameterisasi